ESEPA nace de la urgente necesidad que tenían las iglesias de la Asociación de Iglesias Bíblicas Costarricenses (A.I.B.C.) de un medio eficaz para la capacitación de sus líderes. Guillermo Brown, exdirector de ESEPA elaboró un documento que reúne los inicios (1983) de la planificación y formalización del Seminario, finalizando en el inicio del primer semestre en el nuevo edificio (1993).